Blog

Aug 25, 2023

El 'unnome' cataloga cerca de 2 millones de proteínas. muchos son misteriosos

La base de datos "unnome" clasifica las proteínas humanas según lo poco que sabemos sobre ellas. Muchas proteínas y los genes que las producen no se comprenden bien y todavía hay mucho que aprender del ser humano.

La base de datos "unnome" clasifica las proteínas humanas según lo poco que sabemos sobre ellas. Muchas proteínas y los genes que las producen no se comprenden bien y todavía hay mucho que aprender del libro de instrucciones genética humana.

Richard Jones/Biblioteca de fotografías científicas/Getty Images

Por Skyler Ware

8 de agosto de 2023 a las 15:05

Cuando se trata de fronteras vastas y poco exploradas, nos vienen a la mente el espacio y los océanos de la Tierra. Pero incluso en los cuerpos humanos todavía queda mucho por descubrir. Conozca "unnome", una nueva base de datos que enfatiza cuánto aún no sabemos sobre genes y proteínas humanos.

La base de datos disponible públicamente clasifica grupos de proteínas según lo poco que se sabe sobre ellas. Esa información podría ayudar a los científicos a identificar proteínas para estudios futuros, incluso para el tratamiento de enfermedades y el descubrimiento de fármacos, informan los investigadores el 8 de agosto en PLOS Biology.

El biólogo celular Sean Munro y sus colegas compilaron el unknome, un acrónimo de las palabras desconocido y genoma, para identificar proteínas poco estudiadas pero potencialmente importantes y sus correspondientes genes codificadores de proteínas: ADN que copia la receta de una proteína en ARN (SN: 9/2/22 ).

Las proteínas generalmente se agrupan en familias que tienen un ancestro evolutivo común. La base de datos de unknome contiene todas las familias de proteínas con al menos una proteína codificada por el libro de instrucciones genética humana, o genoma, o por los genomas de otros 11 organismos comúnmente estudiados. Se incluyen más de 13.000 grupos y casi 2 millones de proteínas.

El desconocido asigna una puntuación de "conocimiento" a cada grupo de proteínas en función de cuánto se sabe sobre sus genes correspondientes. Unos 3000 de esos grupos, incluidos 805 que contienen al menos una proteína humana, tienen una puntuación de conocimiento de cero, lo que demuestra que todavía hay mucho que aprender dentro del genoma humano (SN: 31/03/22).

Munro y sus colegas utilizaron la base de datos para estudiar 260 genes compartidos entre las moscas de la fruta y los humanos y que tienen puntuaciones de conocimiento bajas. Después de reducir la actividad de cada uno de los genes codificadores de proteínas en las moscas, los investigadores descubrieron que alrededor de 60 eran esenciales para la vida. Otros eran importantes para la reproducción, el crecimiento, el movimiento y la resistencia al estrés.

“Incluso en [organismos] muy bien estudiados, como las moscas, se pueden encontrar cosas nuevas”, dice Munro, del Laboratorio de Biología Molecular del Consejo de Investigación Médica en Cambridge, Inglaterra.

Aún se desconoce si algunos o todos esos genes tienen efectos similares en los humanos. Pero la base de datos podría ayudar a los investigadores a descubrir proteínas humanas importantes al examinar rápidamente proteínas similares en organismos más fáciles de estudiar, como las moscas de la fruta, dice el científico de datos Tudor Oprea de Expert Systems Inc., una compañía de descubrimiento de fármacos en San Diego, que no participó en el estudio. estudiar.

Munro dice que el siguiente paso de su grupo es trabajar con esfuerzos similares como la Iniciativa de Proteínas Poco Estudiadas para un estudio a gran escala de estas misteriosas proteínas.

Preguntas o comentarios en este articulo? Envíenos un correo electrónico a [email protected] | Preguntas frecuentes sobre reimpresiones

JJ Rocha et al. Desconocimiento funcional: detección sistemática de genes conservados de función desconocida. Más biología. vol. 21, 8 de agosto de 2023. doi: 10.1371/journal.pbio.3002222.

Skyler Ware fue becaria de medios de comunicación de la AAAS 2023 con Science News. Ella es un doctorado de quinto año. Estudiante en Caltech, donde estudia reacciones químicas que usan o crean electricidad.

Nuestra misión es proporcionar al público noticias científicas precisas y atractivas. Esa misión nunca ha sido más importante que hoy.

Como organización de noticias sin fines de lucro, no podemos hacerlo sin usted.

Su apoyo nos permite mantener nuestro contenido gratuito y accesible para la próxima generación de científicos e ingenieros. Invierta en periodismo científico de calidad haciendo una donación hoy.